Sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™
Sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™
Descrição
Um poderoso sistema de particionamento de célula única baseado em micropoços de alto rendimento, combinado com QC de fluxo de trabalho visual.
Visão geral
O sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™ inclui o scanner BD Rhapsody ™ e o sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™ Express. O BD Rhapsody ™ Express System permite a captura de célula única e codificação de centenas a milhares de células individuais para análise de informações genômicas e proteômicas, usando tecnologia de particionamento de célula única baseada em micropoços, proprietária, suave e robusta. O BD Rhapsody ™ Scanner foi projetado para visualizar todas as etapas do fluxo de trabalho de captura de célula única e fornecer métricas de análise detalhadas em cada etapa, permitindo que o usuário tome decisões importantes em todo o fluxo de trabalho.
RECURSOS
O BD Rhapsody ™ Scanner oferece a capacidade de visualizar a captura de uma única célula e fornece métricas de qualidade importantes em cada etapa
O scanner BD Rhapsody ™:
- Permite a inspeção visual do cartucho e de cada micropoço através de uma janela opticamente transparente no cartucho BD Rhapsody ™
- Fornece medidas de controle de qualidade, como taxa de captura de células e taxas de multipleto de células, por imagem direta do cartucho para analisar a qualidade da preparação de células. As métricas de controle de qualidade fornecem uma indicação se ocorreram erros durante o fluxo de trabalho do cartucho, permitindo que você decida se deve prosseguir para o sequenciamento
- Pode ser útil para solucionar problemas e fornecer uma estimativa do número de células que se espera serem recuperadas por sequenciamento
Análise
| Número de poços com células viáveis na carga de células: 9118 |
| Taxa de multipleto celular na carga de célula: 2,4% |
| Número de poços com células viáveis e uma esfera: 7999 |
| Taxa de multipleto celular: 2,0% |
| Eficiência de carregamento do grânulo:
PASSAR |
| Taxa de retenção celular:
PASSAR |
| Eficiência de recuperação do grânulo:
PASSAR |
| Excesso de taxa de cordão:
PASSAR |
ATUAÇÃO
O sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™ fornece resultados confiáveis e reproduzíveis, tornando-o um sistema ideal para estudos translacionais
O sistema oferece taxas de captura de células superiores e taxas de multipleto baixas com uma variedade de tipos de células em comparação com outros sistemas
A forte correlação de todos os marcadores de mRNA e proteínas identifica populações de células T semelhantes entre os cartuchos
Dados equivalentes de réplicas biológicas
Dados equivalentes de contas subamostradas
Proporções semelhantes de cada tipo de célula são recuperadas de WTA e ensaios direcionados realizados em grânulos subamostrados.
O BD Rhapsody ™ Single-Cell Analysis System permite a medição simultânea de proteínas de superfície e expressão de mRNA, facilitando a identificação de subconjuntos distintos de células T reguladoras
A expressão diferencial do gene e a análise da expressão diferencial da proteína foram realizadas em três subconjuntos principais de Treg identificados com base no bloqueio manual e na análise bivariada de amostras Treg classificadas por CD45RA e HLA-DR. A análise da expressão diferencial do gene foi realizada usando o BD Rhapsody ™ Targeted Human Immune Response Panel (399 genes). Genes regulados positivamente (> 1,25X) são mostrados no mapa de calor acima. A expressão diferencial de proteínas de 22 proteínas foi realizada simultaneamente usando BD ® AbSeq Oligo-Conjugated Antibodies.
O sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™ pode ser usado para caracterização profunda de células T exauridas
Expressão de 12 proteínas e genes que são significativamente regulados positivamente no dia 14 da simulação crônica de células T CD8 +. Duas populações (caixas vermelhas e verdes) surgiram com base no nível de expressão dos marcadores. Os padrões de co-expressão foram discernidos para CD38, CD39 e CD94.
O sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™ permite a resolução da heterogeneidade inata de células linfóides
Proteína diferencial e expressão gênica no nível de uma única célula.
A heterogeneidade foi observada nos principais subconjuntos de ILC.
O sistema de análise de célula única BD Rhapsody ™ permite a identificação de heterogeneidade nas amostras CLL
Os clusters são bem definidos usando mRNA simultâneo e análise de proteínas. As amostras de doadores saudáveis agrupam-se de forma semelhante. As amostras CLL agrupam-se separada e exclusivamente.
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